DNA 或 RNA 萃取進入二、三十個樣本的批次後,研究人員面對的不只是「能不能抽出核酸」,還包括每支樣本是否以相同時間完成裂解、清洗與洗脫。MACHEREY-NAGEL(MN)提供傳統離心柱、NucleoVac 24 真空歧管及 NucleoMag X32 自動化磁珠平台。三者使用的分離原理與試劑不同,也對應不同的樣本量、人力配置及標準化需求。
兩條多通量路徑:平行管柱與磁珠自動化
NucleoVac 24(REF 740299)可同時連接 1–24 支 NucleoSpin 或 NucleoSnap 管柱。核酸在高鹽條件下吸附於矽膠膜,真空負壓讓結合液與清洗液同步通過管柱。它保留研究人員熟悉的 column workflow,卻減少逐管放入離心機、取出管柱與倒除廢液的動作。加液、換液與洗脫仍由人員執行。
NucleoMag X32(REF 747020)使用順磁性磁珠。核酸吸附於磁珠後,磁棒系統將磁珠依序移入清洗液與洗脫液,自動完成混合、磁珠轉移、清洗及洗脫。原廠列出的通量為 1–32 個樣本,處理體積為 50–1000 µL;不同試劑與程式的機器運轉時間約 20–60 分鐘。樣本前處理、裂解及耗材配置仍需由實驗人員完成。
原廠規格
| 項目 | NucleoVac 24 | NucleoMag X32 |
|---|---|---|
| 產品編號 | REF 740299 | REF 747020 |
| 純化原理 | 矽膠膜管柱搭配真空負壓 | 順磁性磁珠與磁棒轉移 |
| 樣本通量 | 1–24 支管柱 | 1–32 個樣本 |
| 處理體積 | 依相容管柱與試劑盒手冊 | 50–1000 µL |
| 主要耗材 | NucleoSpin/NucleoSnap 管柱、轉接頭與收集容器 | 96 deep-well plate、tip comb、洗脫盤或樣本條 |
| 自動化範圍 | 以真空完成部分結合與清洗步驟 | 混合、磁珠轉移、清洗與洗脫 |
| 研究限制 | 需確認個別 kit 是否支援真空流程 | 需匹配 kit、程式與耗材配置;運轉時間不含前處理 |
「24 支」或「32 個樣本」描述的是批次通量,不是核酸產量。回收量仍由起始材料、裂解效率、管柱或磁珠結合容量、洗脫體積及抑制物共同決定。平台降低的是重複操作,不會自動補回裂解不足或保存不當造成的損失。
X32 可搭配哪些 NucleoMag 試劑?
MN 已提供多種預先驗證或可取得的 X32 執行程式。血液與組織 DNA 可選 NucleoMag Blood 200 µL、Tissue 或 HMW DNA;RNA 研究可評估 RNA Pro、RNA Blood 與 RNA/DNA Pro;低濃度或感染性研究樣本則有 cfDNA、Virus、Pathogen 與 VET 系列。其他方向包含 Plasmid、NGS Clean-up and Size Select、DNA Swab、DNA FFPE、DNA Forensic、Plant、DNA/RNA Water、DNA Bacteria、DNA Microbiome 與 DNA Food。
部分產品另有 Blood、Tissue、Pathogen 與 VET 的 Prefilled 版本,可減少逐孔分裝緩衝液。預填盤降低的是試劑配置步驟,並不代表樣本可略過前處理;研究人員仍須依 loading scheme 放置樣本、tip comb、deep-well plate 與洗脫容器。程式名稱、適用輸入與執行時間應以原廠 X32 scripts 清單及對應 kit 手冊為準。
NucleoVac 24 可使用哪些管柱試劑?
NucleoVac 24 服務的是矽膠膜管柱流程。原廠產品頁列有 NucleoSnap cfDNA(REF 740300.50)與 NucleoSnap Plasmid Midi(REF 740494.50),部分 NucleoSpin kit 也能依手冊把結合或清洗步驟改用真空處理。管柱能接上歧管,不代表整套流程都能改成真空;膜乾燥、離心速度及洗脫方式可能仍有指定條件,建立 SOP 前必須核對個別手冊。
依工作量選擇操作方式
少量或臨時批次
離心柱設備需求低,也方便調整裂解與洗脫條件。樣本增加時,重複 handling 與放錯管位的風險會升高。
約 12–24 個樣本
NucleoVac 24 適合延續既有 column workflow,以平行真空處理降低反覆離心與倒廢液的負擔。
固定中高通量
X32 適合重視標準化及較低 hands-on time 的實驗室,但需先建立 kit、程式、耗材與前處理的固定組合。
可支援的研究應用
基因體分析與 NGS
血液、組織、細胞或植物可配合相對應的 DNA kit,再進入 PCR、qPCR 或 NGS 建庫。若目標是長片段定序,應選用 HMW DNA 流程並控制混合造成的剪切;濃度之外,也要量測片段完整性。
RNA 表現與轉錄體研究
RNA Pro、RNA Blood 或 RNA/DNA Pro 可用於 RT-qPCR、cDNA 製備與轉錄體研究。A260/A280 只能反映部分純度訊息,不能證明 RNA 完整;建議搭配螢光定量、RIN 或片段分析,並設置 no-RT control 檢查基因組 DNA 殘留。
病原體與病毒研究
Virus、Pathogen 與 VET 系列可處理體液、拭子或組織等研究樣本。每批應包含萃取空白、陽性製程控制與內部擴增控制,用來區分低濃度陰性、萃取失敗與 PCR 抑制。
微生物相與環境樣本
糞便、土壤、食品與水樣可能含有多醣、多酚或其他酵素抑制物。自動化可固定清洗節奏,卻不能取代合適的均質、裂解與抑制物去除;樣本基質仍是 kit 選擇的核心。
多通量流程的重現性檢核
- 記錄採樣時間、保存溫度、凍融次數與實際輸入量。
- 固定裂解時間、均質方式、加液順序與操作者訓練。
- 確認緩衝液是否已加入乙醇,並記錄配製日期與 lot。
- 保存 X32 程式名稱、版本、處理體積與加熱設定;真空流程則記錄壓力範圍。
- 以 plate map 追蹤樣本、空白與控制品位置,保留 kit、磁珠與耗材批號。
- 依下游用途設定 Qubit、純度比值、RIN、片段完整度或 qPCR 抑制測試。
方便性不是「按下啟動鍵」而已
NucleoVac 24 的便利性在於保留管柱化學,同時把多支 column 的結合與清洗平行化;X32 的便利性則是固定磁珠轉移、清洗與洗脫節奏,降低人工介入。選擇時應從一週實際批次量、樣本種類、可接受的前處理時間與品質控制倒推,而不是只比較單次可放多少樣本。
兩套平台與相關 kit 皆僅供研究使用,不用於臨床診斷。處理人類或動物來源樣本時,仍須遵循機構生物安全與倫理規範;裂解液、結合液及含酒精緩衝液應依原廠安全資料表操作與處置。
本文依 MACHEREY-NAGEL 公開資料整理,包括 NucleoVac 24 原廠產品頁、NucleoMag X32 原廠產品頁、X32 規格與相容試劑手冊及程式清單。試劑相容性、程式、包裝與供應狀態可能調整,採購或建立正式 SOP 前應核對現行手冊並以實際樣本驗證。